La sensibilità verso i temi ecumenici e il confronto con le altre realtà religiose sono un tratto distintivo della CELI. In Italia, assieme a Valdesi, Metodisti, Battisti ed Esercito della Salvezza, è membro fondatore della Federazione delle Chiese Evangeliche in Italia. Con la Chiesa Cattolica, ha un dialogo attivo e relativo, soprattutto, ad aspetti pratici pastorali, in quanto sono molte le famiglie di confessione mista luterano-cattolica.

A livello internazionale la CELI è membro della Federazione Luterana Mondiale (FLM), della Conferenza delle Chiese Europee (CEC), e della Comunione delle Chiese Evangeliche in Europa (CCPE – Comunione di Leuenberg). E ha stretti contatti con la Chiesa Evangelica di Germania (EKD) e con l’Unione delle Chiese Evangeliche-Luterane di Germania (VELKD).

La CELI è impegnata nel dialogo ebraico-cristiano e, dal 1998, è membro della Commissione Luterana Europea per Chiesa ed Ebraismo (Lutherische Europäische Kommission für Kirche und Judentum, LEKKJ). Esiste un forte rapporto di collaborazione e sostegno reciproco con il Gustav Adolf Werk e il Martin-Luther-Bund che appoggiano finanziariamente e teologicamente  le chiese e le comunità evangeliche (il secondo, specificamente, quelle luterane) nei paesi in cui rappresentano una minoranza.

Negli ultimi anni, la CELI ha rafforzato i rapporti con le altre chiese luterane all’estero, anch’esse di minoranza, ad esempio attraverso il gemellaggio con la Chiesa evangelica di Confessione Augustana in Slovenia (2000), la Chiesa Evangelica d’Austria (2007) e la Chiesa Evangelica Luterana d’Ungheria (2010).